ژن لپتین به عنوان یک ژن کاندیدا و تنظیم کننده مهم در فرآیندهای مرتبط با صفات اقتصادی شناخته شده است. در این تحقیق، به منظور شناسایی چندشکلی ژن لپتین از 200 راس گاو نژاد بومی و آمیخته استان گیلان خونگیری شد. استخراج DNA به روش نمکی و تکثیر یک قطعه 522 جفت بازی این ژن توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای اختصاصی صورت گرفت و سپس با آنزیم محدودگر BsaAI هضم و نمونه ها تعیین ژنوتیپ شدند. برای جایگاه مورد مطالعه دو الگوی باندیA و B به ترتیب با فراوانی 0/455 و 0/545 در گاو بومی و 0/365 و 0/635 در گاو آمیخته شناسایی شد. فراوانی ژنوتیپ های مشاهده شده AA، AB و BB به ترتیب 0/19، 0/53 و 0/28 در گاوهای بومی و 0/14، 0/45 و 0/41 در گاوهای آمیخته به دست آمد. براساس نتایج آزمون مربع کای، جمعیت های مورد بررسی در تعادل هاردی- واینبرگ قرار داشتند. شاخصهای نئی و شانون، هتروزیگوتی مشاهده شده و مورد انتظار به ترتیب 0/496 و 0/689، 0/53 و 0/498 در گاو بومی و 0/464 و 0/656، 0/45 و 0/466 محاسبه گردید. نتایج این مطالعه نشان داد که این ناحیه از ژنوم در گاوهای مورد مطالعه چندشکل بوده و تکنیک PCR-RFLP توانای شناسایی چندشکلی ها را دارد.