بررسی آرایه شناسی جنس Paraschistura (در جنوب ایران) با استفاده از توالی ژن میتوکندریایی (COI)

نوع مقاله: سیستماتیک جانوری

نویسندگان

1 گروه محیط زیست دریایی، دانشکده محیط زیست، کرج، ایران

2 گروه شیلات، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی کرج، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

چکیده

بررسی  تنوع و ساختار ژنتیکی گونه ­های مختلف ماهیان از اساسی ­ترین شاخص ­های لازم برای حفظ و بازسازی ذخایر آن­ ها است. این مطالعه بر آن است تا با استفاده ازروش ­های مولکولی با استفاده از توالی‏­ های به‌ ­دست ‌آمده از ژن سیتوکرم ­اکسیداز COI به بررسی آرایه ­شناسی سگ­ ماهی جویباری جنس Paraschistura در جنوب ایران بپردازد. به این منظور نمونه بالغ از هر گونه که شامل:7عددگونه  P. bamporensis، سه عدد گونه P. sargadensis، چهار عدد گونه P. hormozensis، و پنج عدد گونه Parascshistura sp.، از حوضه های جنوبی ایران جمع ­آوری گردید، DNA نمونه­ ها با استفاده از کیت ژنومی و پرایمر FCOI20ʹ استخراج گردیدو طیفرآیند PCR تکثیرو پس از الکتروفورز توالی­ یابی انجام گرفت. جهت بررسی روابط فیلوژنی توالی ­های ژن COI از نرم ­افزار MEGA6 استفاده گردید. نتایج این بررسی نشان داد که نمونه ­های جنس   Paraschistura در چهار کلاد قرار گرفته ­اندنمونه ­های P. bamporensis از حوضه ­های مختلف با فاصله تکاملی (0/128-0/005) به ­همراه P. sargadensis و Parascshistura sp از حوضه سرباز در یک کلاد قرار گرفته ­اند. نمونه ­های  P. hormozensis با دارا بودن فاصله تکاملی (0/042)، در کلاد مجزایی قرار دارند. به ­همین ترتیب P. abdolii ،P. naumani و P. delvarii و با دارا بودن فواصل تکاملی (0/185-0/030) و نمونه Parascshistura sp. با فاصله تکاملی (0/206-0/042) در کلادهای مجزایی قرار گرفته ­اند. با توجه به فاصله حوضه ­ها از هم و بررسی خصوصیات مورفولوژی، نتایج مولکولی با نتایج مرفولوژیکی موجود مطابقت داشت. تجزیه و تحلیل درخت فیلوژنی در این مطالعه نشان می ­دهد ویژگی­ های ریخت­ شناسی مورفولوژیک به ­همراه شناسایی مولکولی برای تایید تشخیص گونه‌ها ضروری می‌ باشد.

کلیدواژه‌ها


  1. Abdoli, A., 2000. The Inland Water Fishes of Iran. Iranian Museum of Nature and Wild life. Tehran.
  2. Berg, L.S., 1949. Freshwater fishes of Iran and adjacent countries. Trady Zoologii Icheskogd Institute Academic. Nauk U.S.S.R.; (in Russia). Vol. 8, pp: 783-858.
  3. Berg, L.S., 1948-1949. Freshwater fishes of the U.S.S.R. and adjacent countries. Part. 2. Fourth edition. Izdatelstvo Akademii Nauk SSSR, Moskva and Leningrad. pp: 470-925.
  4. Bânârescu, P. and Nalbant, T.T., 1966. The 3rd Danish Expedition to Central Asia. Zoological results 34. Cobitidae (Pisces) from Afghanistan and Iran. Videnskabelige Meddelelser fra Dansk Naturhistorisk Forening i Kobenhavn. Vol. 129, pp: 149-186.
  5. Bănărescu, P.M. and Nalbant, T.T., 1998. Cobitis elongata Heckel and Kner, 1858 (Pisces: Ostariophysi: Cobitidae): distribution, relationships, geographical variation and protection status. Revue.
  6. Coad, B.W., 2014. Freshwater Fishes of Iran. Available from: www.briancoad.com. Retrieved 9/10/2014.
  7. Diz, P.A. and Presa, P., 2009. The genetic diversity pattern of Mytilus alloprovincialis in GalicianRías (NW Iberian estuaries). Aquaculture. Vol. 287, pp: 278-285.
  8. Freyhof, J.; Sayyadzadeh, G.; Esmaeili, H.R. and Geiger, M., 2015. Review of the genus Paraschistura from Iran with description of six new species (Teleostei: Nemacheilidae). Ichthyological Exploration of Freshwaters. Vol. 26, No. 1, pp: 1-48.
  9. HashemzadehSegherloo,L.;Bernatchez,L.; Golzarianpour, K.; Abdoli, A.; Primmer, C.R. and Bakhtiary, M., 2012. Genetic differentiation between two sympatric morphs of the blind Iran cave barb Iranocypris typhlops. J of Fish Biology. Vol. 81, No. 5, pp: 1747-1753.
  10. Hansen, M.M.; Nielsoen, E.E.; Bekkevold, D. and Mensberg, K.L.D., 2001. Admixture analysis and stocking impact assessment in Brown trout (Salmo trutta) estimated with incomplete baseline data. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic sciences. Vol. 58, No. 18, pp: 18-27.
  11. Hebert, P.D.N.; Cywinska, A.; Ball, S.L. and deWaard, J.R., 2002. Biological identifications through DNA barcodes. The Royal Society.
  12. Hebert, P.D.N.; Cywinska, A.; Ball, S.L. and deWaard, J.R., 2003. Biologicalidentifications through DNA barcodes. Proceedings of the Royal Society. Vol. 270, pp: 313-322.
  13. Kimura, M., 1980. A simple method of estimating evolutionary rate of base substitutions throuth comparative studies of nucleotide sequences. Journal of molecular Evolution. Vol. 16, pp: 111-120.
  14. Kottelat, M., 2012. Conspectus Cobitidum*: An Inventory of the Loaches of the World (Teleostei: Cypriniformes: Cobitoidei).  The Raffles Bulletin of Zoology, Supplement. Vol. 26, pp: 1-199.
  15. Mousavi-Sabet, H. and Eagderi, S., 2015. Paraschistura delvarii spec. nov.  a new species of stone loach from the Persian Gulf basin, southern Iran (Teleostei: Nemacheilidae). Published online at www.senckenberg.de /vertebrate zoology on 13.xi.2015. Vol. 65, No. 3, pp: 297-303.
  16. Mousavi-Sabet, H.; Vatandoust, S.; Khataminejad, S.; Eagderi, S.; Abbasi, K.; Nasri, M.; Jouladeh, A. and Vasil’eva, E.D., 2015. Alburnus amirkabiri (Teleostei), a New Species of Shemaya from the Namak Lake Basin, Iran. Journal of Ichthyology. Vol. 55, No. 1, pp: 40-52.
  17. Nalbant, T.T. and Bianco, P.G., 1998. The loaches of Iran and adjacent regions with description of six new species (Cobitoidea). Italian Journal of Zoology. Vol. 65, pp: 109-123.
  18. Nei, M., 1972. Genetic distance between populations. ASN. Vol. 106, No. 949, pp: 283-292.
  19. Pinera, J.A.; Blanco, G.; Vázquez, E. and Sánchez, J.A., 2007. Genetic diversity of black spot seabream (Pagellus bogaraveo) populations Spanish Coasts: a preliminary study. Marin Biology. Vol. 151, pp: 2153-2158.
  20. Prokofiev, A.M., 2009. Problems of the classification and phylogeny of Nemacheilin loaches of the group lacking the preethmoid I (Cypriniformes: Balitoridae: Nemacheilinae). Journal of Ichthyology. Vol. 49, pp: 874-898.
  21. Qian, X.; Fei, C.; Shin, P.K.S.; Cheung, S.G.; Yan, C. and Caihuan, K., 2011. AFLP analysis of genetic variation among three natural population of horseshoe crab Tachypleus tridentatus along Chinese coast. Chinese journal of Oceanology and limnology. Vol. 29, pp: 284-289.
  22. Regan, C.T., 1911. A synopsis of the marsipobranchs of the order Hyperoartii. Ann. Mag. Nat. Hist. Vol. 7, No. 8, pp: 193-204.
  23. Tamura, K.; Dudley, J.; Nei, M. and Kumar, S., 2007. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0. Molecular Evolution. Vol. 24, pp: 1596-1599.
  24. Vatandoust, S. and Eagderi, S., 2015. Paraschistura ilamensis, a new species of loach from the Tigris River drainage (Teleostei: Nemacheilidae).  International Journal of Aquatic Biology. Vol. 3, No. 3, pp: 177-182.
  25. Webb, K.E.; Barnes, D.K.A.; Clark, M.S. and Bowden, D.A., 2006. DNA barcoding: A molecular tool to identify Antarctic marine larvae. Deep-Sea Research. Vol. 53, pp: 1053-1060.
  26. Zhang, D.X. and Hewitt, G.M, 2003. Nuclear DNA analyses in genetic studies of populations: practice, problems and prospects. Molecular Ecology.Vol. 12, pp: 563-584.
  27. Zhao, Y.; Li, Q.; Kong, L.; Bao, Z. and Wang, R., 2007. Genetic diversity and divergence among clam Cyclina sinensis populations assessed using amplified fragment length polymorphism. Fisheries Science. Vol. 73, pp: 1338-1343.